En
   

Cambridge Structural Database (CSD)

Основанный в 1965 году, Кембриджский банк структурных данных (Сambridge Structural Database) является всемирным хранилищем кристаллических структур низкомолекулярных органических и металлоорганических соединений. В базе содержатся данные о координатах атомов, угловых и линейных межатомных параметрах для более чем 1 000 000 соединений, определенные в результате рентгеновских и нейтронных дифракционных анализов, что делает ее важным ресурсом для ученых всего мира. Каждая запись базы данных дополняется библиографическими и химическими сведениями, а также информацией о физических свойствах, увеличивая ценность непосредственно структурных данных. Банк данных регулярно пополняется новыми структурами (сейчас это уже более 60 000 структур в год) и совершенствует существующие записи. Кроме того, программа поддерживает регулярное веб-обновление и онлайн доступ к недавно опубликованным структурам. CSD предоставляет широкий спектр вариантов поиска кристаллических структур, например: по названию, химической формуле, элементному составу, литературному источнику, деталям эксперимента, фрагменту структуры.

 

База данных CSD Enterprise - электронный ресурс Кембриджского центра структурных данных (The Cambridge Crystallographic Data Centre / CCDC).

В рамках национальной подписки государственные (бюджетные) учреждения науки и высшего образования Российской Федерации могут получить доступ к следующим сервисам:

 

1) Web SCD: онлайн-порталы WebCSD и Relibase+ (база данных кристаллических структур макромолекул) с возможностями сравнительного анализа, записи и хранения отдельных частей.

 

2) CSD System: Cambridge Structural Database, а также сервисы: 

- ConQuest (поиск структурных данных в CSD, позволяющий сохранение записей базы данных)

- IsoStar (библиотека параметров межмолекулярных взаимодействий)

- Mercury (программы для визуализации и анализа структурных данных)

- Mogul (программы для валидации геометрии структур молекул).

 

3) CSD Enterprise:

- DASH (программа для анализа данных рентгеновской порошковой дифракции)

- GOLD (программа молекулярного докинга)

- SuperStar (программа для предсказания активных центров макромолекул)

- CrossMiner(интерактивный инструмент для поиска фармакофорных признаков в БД CSD и Protein Bank Database).

 

База данных Cambridge Structural Database доступна в двух версиях:

  • стационарное ПО (1 034 174 записи о кристаллическом строении 1 016 168 органических и металлорганических соединений на 01.01.2020, дополняется три раза в год)
  • онлайн-версия (дополняется ежедневно, дополнительно содержит 180 000 записей о строении неорганических соединений и минералов).

 

Скачать комплекс программ CSD-Enterprise: https://www.ccdc.cam.ac.uk/support-and-resources/csdsdownloads/

Описание основных возможностей программного обеспечения CSD-Enterprise: https://podpiska.rfbr.ru/storage/materials/CSDcomponents.pdf

Краткое руководство пользователя онлайн-портала Web CSD: https://podpiska.rfbr.ru/storage/instructions/webCSD.pdf

Документация на ПО через официальный сайт разработчика: https://www.ccdc.cam.ac.uk/support-and-resources/ccdcresources

В аудитории 210 НТБ всё вышеперечисленное ПО установлено на компьютере №32 для студентов и сотрудников ТПУ.

Для установки ПО на рабочем компьютере, находящимся в сети ТПУ, необходимо оформить заявку через https://help.tpu.ru/

 

Адрес для работы в сети ТПУ: https://www.ccdc.cam.ac.uk/structures/

Адрес для работы вне сети ТПУ: https://ezproxy.ha.tpu.ru:2443/login?url=http://www.ccdc.cam.ac.uk/structures/

Срок доступа: 31.12.2021

 

Комментарии [0]

Нажмите здесь, чтобы отменить ответ.
    Комментарии остутствуют